Anfänge: Grube an der Wublitz, Rittersitz und Besitz der Falke
Der Ortsname geht vermutlich auf eine slawische Grundform *Groby zurück, die eine durch Gräben geschützte Siedlung meint; auf der Gemarkung fanden sich Spuren eines slawischen Dorfes aus dem mittleren und späten Mittelalter. Später glich man die Schreibung an das deutsche Wort Grube an.
Der Ort liegt südlich des Schlänitzsees an einem Abschnitt, wo die Wublitz einen Bogen macht und breiter wird.
In die schriftliche Überlieferung tritt der Ort 1265 ein, aber nur mittelbar: Als Zeuge einer Urkunde vom 6. April 1265 erscheint ein Albertus de Grobe. Den Rittersitz in Grube, den Kylian von der Gröben zuvor aufgegeben hatte, übertrugen die Landesherren am 12.
Mai 1349 an die Zossener Herren Boto und Friedrich von Torgow. Die Reihe der Besitzer lässt sich von da an über Urkunden weiterverfolgen.
Im 15. und 16.
Jahrhundert lag der Rittersitz bei der Familie von Falke. 1427 erhielt Dorothea, die Frau Albrechts von Falke, einen Hof in Grube als Leibgedinge (Witwenversorgung), und 1537 bestätigte der Landesherr den Vettern Erich und Achim von Falke das Lehen samt Ober- und Niedergericht, Gewässern, Weiden, Holzungen und Wiesen.
Das Patronat über die Kirche, das Recht der Pfarrbesetzung, lag dagegen beim Benediktinerinnenkloster Spandau, nach der Säkularisation 1541 beim Klosteramt Spandau. Um 1500 war Grube Tochterkirche von Bornim.
1530 bis 1801: Kossätendorf, Amtsvorwerk und Schweizer Siedler in Nattwerder
1530 sind zwei Hüfnerhöfe und ein weiterer Hof verzeichnet, 1624 lebten zwei Hüfner, acht Kossäten (Kleinbauern), ein Hirte und ein Hirtenknecht im Dorf.
Die Feldmark umfasste vier Bauernhufen und vier Ritterhufen der Falke. 1660 kaufte Kurfürst Friedrich Wilhelm das Dorf für 6.500 Taler aus dem Vermögen des zahlungsunfähigen Caspar Joachim von Falke und unterstellte es dem Amt Potsdam.
Um 1700 entstand ein Vorwerk, ein vom Amt betriebener landwirtschaftlicher Hof. 1708 lagen die vier Bauernhufen unbesetzt und wurden vom Amt bewirtschaftet; von sieben Kossätenstellen waren drei leer. 1734 löste König Friedrich Wilhelm I.
Grube und Bornstedt aus dem Amt Potsdam und übertrug beide dem Großen Militärwaisenhaus in Potsdam, dessen Besitz das neu geschaffene Amt Bornstedt verwaltete. 1738 stritten Fischer aus Grube und Phöben um die Fischerei auf der Wublitz.
Die bestehende Dorfkirche entstand 1745/46 als verputzter Backsteinsaal mit eingezogenem Westturm; ein Vorgängerbau von 1590 war bis dahin in Gebrauch. Die Bronzeglocke goss 1745 der Berliner Johann Christian Schultze. Ein Schulhaus gab es vermutlich seit der Mitte des 18.
Jahrhunderts, 1782 wurde es erweitert. 1776 legte man die Kolonie Neu Grubow an, in der um 1800 sechs Gärtner wohnten.
Zum heutigen Ortsteil gehört Nattwerder, das 1685 als Dorf Schweizer Siedler entstand. Kurfürst Friedrich Wilhelm hatte sich 1683 an die Stadt Bern gewandt, um Bauern zu gewinnen. Am 18.
Juni 1685 kamen 14 Familien mit ihren Knechten und Mägden an, zusammen 103 Personen; für Werkzeug und Saatgut gab es Geld, drei Jahrzehnte lang blieben sie abgabenfrei. Noch 1685 baute man die reformierte Kirche, 1768 ein Schöpfwerk, das die Moore entwässerte.