Bis 1918: Schule, Kirche und der Hohenzollernkanal
Für den Unterricht richtete das Dorf 1822 ein eigenes Haus ein, in dem neben einem einzigen Klassenraum auch der Lehrer wohnte. Ein Brand traf 1832 Kirche und Pfarrhaus, die alte Fachwerkkirche blieb baufällig. 1834 entstand ein neues Schul- und Küsterhaus. Das alte Kirchengebäude wurde 1846 für 386 Taler versteigert.
Der Ersatzbau, eine Ziegelfachwerkkirche östlich des früheren Standorts, wurde am 24. Dezember 1848 von Pfarrer Heydemann eingeweiht. Die 1845 gegossenen Glocken wurden im Ersten Weltkrieg eingeschmolzen.
Um 1845 gab es eine Försterei und eine Schützengilde.
Der Ort zählte 1856 in 150 Häusern 1.724 Einwohner, 1875 waren es 1.753. 1874 wurden Alt-Zerpenschleuse, Berg und Kienitz sowie das Gut erstmals zum Amtsbezirk Zerpenschleuse zusammengefasst; im selben Jahr entstand der Männergesangverein „Concordia“. 1888 folgte ein Männerturnverein, 1905 die Freiwillige Feuerwehr.
Zwischen 1907 und 1914 wurde der Hohenzollernkanal gebaut, der heutige Oder-Havel-Kanal. Er übernahm den Großteil des Schiffsverkehrs, der Finowkanal und mit ihm der Schifferort Zerpenschleuse verloren an Bedeutung.
1919 bis 1945: Eine Gemeinde, zugeschüttete Schleusen, Kriegsende
1919 vereinigten sich Alt-Zerpenschleuse, Berg und Kienitz zur Gemeinde Zerpenschleuse. 1924/25 wurden die beiden Schleusenkammern südöstlich des Ortes zugeschüttet; der Finowkanal war damit unterbrochen. Der westliche Rest als stehendes Gewässer heißt seitdem Langer Trödel. Ebenfalls 1924 gründete sich der Fußballverein Minerva.
Einwohner von Zerpenschleuse früher
1939 wohnten 1.899 Menschen im Ort, 1933 waren es 1.814 und 1925 erst 1.679. 1935 ersetzte ein Damm die Zugbrücke im Zug der heutigen Straße nach Berlin, die Zugbrücke an der Glashütte wurde 1944/45 abgerissen. Am 24. April 1945 rückte die Rote Armee ein.
DDR-Zeit: Kinderwochenheim, Genossenschaften und Konsum
Bereits 1948 entstand die im Krieg zerstörte Bahnbrücke über den Oder-Havel-Kanal als Stahlbetonbogen neu. 1951 ließ sich der Sportverein Minerva neu eintragen. 1952 erwarb das Finanzministerium der DDR das frühere Landschulheim und baute es zum Kinderwochenheim „Seid bereit“ aus; nach fünf Jahren wurde es geschlossen und ging an die LPG.
Von 1956 bis 1959 entstanden eine Produktionsgenossenschaft des Handwerks für Kraftfahrzeuginstandsetzung sowie die LPG „Freier Bauer“ und die LPG „Morgensonne“, die nach unterschiedlichen Typen organisiert waren (III und I). 1959 zog ein Lebensmittelkonsum in das frühere Lokal „Zur feuchten Ecke“ ein, im selben Jahr nahm die erste Kinderkrippe des Ortes ihren Betrieb auf. 1969 und 1971 schlossen sich die beiden Genossenschaften der LPG Stolzenhagen an.
Die Bevölkerungszahl sank in dieser Zeit stetig: Von 1.928 Einwohnern 1950 ging sie auf 1.623 (1964), 1.595 (1971) und 1.205 Ende 1989 zurück.
Seit 1990: Schulschließung, Kirchensanierung und Eingemeindung
Am 3. Oktober 1990 hatte der Ort 1.178 Einwohner. Am 3. Juli 1991 wurde die Ortsschule geschlossen; die Kinder besuchen seither Schulen in Klosterfelde, Marienwerder und Liebenwalde. 1992 begann die Restaurierung der Dorfkirche, die in den 1990er Jahren Fachwerk und Holzkonstruktion sanierte.
Beim Ausbau der Heidekrautbahn wurde 1999 die alte Kanalbrücke der Strecke gesprengt; an ihre Stelle trat ein Stahlbogen.
Die selbstständige Gemeinde im Amt Groß Schönebeck legte noch am 19. September 2003 den Grundstein für eine Mehrzweckhalle. Zum Wahltag der Kommunalwahlen, dem 26. Oktober 2003, ging sie in der Gemeinde Wandlitz auf und ist seither deren Ortsteil. 2004 entstand neben dem Sportplatz die Sporthalle des Vereins Minerva.
2006 wurde die Kindertagesstätte „Eichhörnchen“ vom Kneippbund anerkannt; der Neubau der Einrichtung wurde am 30. Juni 2011 eingeweiht. 2008 kam anstelle des nicht zurückgekehrten Altargemäldes eine Neufassung von Corinna Bensemann in die Kirche, im September desselben Jahres fand das erste Drachenbootrennen auf dem Langen Trödel statt.
Zwischen 2013 und 2016 wurde dieser Kanalabschnitt ausgebaut und eine neue Schleuse errichtet.
Was Zerpenschleuse heute prägt
Beim Zensus am 15. Mai 2022 wurden 840 Einwohner gezählt, 2011 waren es 860. Gegenüber den 1.013 Einwohnern des Jahres 2002 hat der Ort rund ein Sechstel seiner Bevölkerung verloren. Eine Vertretung der Bürger bildet der Ortsbeirat der Gemeinde Wandlitz mit beratender Funktion.
Seit dem 1. Januar 2019 unterhält der Wasser- und Bodenverband „Schnelle Havel“ den Langen Trödel, der seit der Saison 2016 wieder Teil des durchgehend befahrbaren, 42 Kilometer langen Finowkanals ist. Im Ort kreuzen sich die Bundesstraße 167 und die frühere Bundesstraße 109.
Die Heidekrautbahn berührt das östliche Gemeindegebiet; ihr Haltepunkt Ruhlsdorf-Zerpenschleuse liegt auf Ruhlsdorfer Gebiet.
Ein privater Hof hält auf rund 50 Hektar kleinwüchsige und seltene Tierrassen, darunter Dexter-Rinder und Ouessantschafe. Zu den wiederkehrenden Terminen zählen das Drachenbootrennen auf dem Langen Trödel und ein Osterfeuer; der Sportverein Minerva besteht seit 1924.
