1861 bis 1930: Feuerwehr, Bahnhof und Kiesgrube
Im 19. Jahrhundert blieb Germendorf klein: 1875 lebten dort 696 Menschen, 1890 waren es 642, und bis 1910 stieg die Zahl auf 791.
Seit 1904 gibt es im Ort eine Freiwillige Feuerwehr, die später eine Jugend- und eine Kinderfeuerwehr aufbaute. 1915 wurde der Bahnhof Germendorf eröffnet, gebaut zusammen mit der Strecke Nauen–Oranienburg.
Er rückte das Dorf näher an Berlin und brachte einen ersten Zuwachs an Einwohnern; für Arbeiter entstanden neue Wohnviertel, die das Bild des alten Angerdorfes veränderten. Im Jahr 1925 zählte der Ort 918 Einwohner.
Im Westen wird seit 1928 eine Kiesgrube betrieben, unter anderem auf einem Grundstück des Malers Erich Buchholz (1891–1972). Auch das Vereinsleben begann: 1926 gründete sich ein Radfahrverein, der 1930 eine Fußballmannschaft aufstellte. Nach dem Zweiten Weltkrieg wurde die Mannschaft zunächst verboten und erst 1950 als SG Germendorf wieder gegründet.
Heinkel-Werke und Zwangsarbeit: Germendorf 1933 bis 1945
Am 18. März 1935 wählte das Reichsluftfahrtministerium Oranienburg und Germendorf als Standort für ein zweites Heinkel-Werk. Baubeginn war am 4. Mai 1936, die Eröffnungsfeier folgte am 4. Mai 1937.
Einwohner von Germendorf früher
Das Werk I, auch Oberwerk genannt, stand im Germendorfer Forst südlich des Dorfes auf 110 Hektar mit acht Standardhallen; die Serienfertigung der He 111 begann im April 1937. Bis 1939 stieg die Einwohnerzahl des Dorfes von 1.064 (1933) auf 1.262.
Die Beschäftigtenzahl des Unternehmens wuchs von 7.360 im November 1938 auf den Höchststand von 14.215 im September 1943. Seit Ende 1939 lebten Kriegsgefangene und Zwangsarbeiter aus mehreren Ländern in einem Barackenlager an der Veltener Straße, das bis zu 3.000 Menschen fasste.
Ab März 1942 mussten Häftlinge des KZ Sachsenhausen dort arbeiten, und spätestens im März 1943 bestand ein Außenlager auf dem Gelände des Werks I.
Im Juni 1944 erreichte die Zahl der Häftlinge mit 6.966 ihren Höchststand. Am 18. April 1944 griffen amerikanische Bomber das Werk I zum ersten Mal an. Ein einzelner Luftangriff forderte besonders viele Opfer; dabei starben unter anderem 106 Häftlinge.
Je nach Schätzung leisteten zwischen 6.240 und 8.000 Häftlinge Zwangsarbeit, und über 1.500 Gefangene wurden getötet.
Am 22. und 23. April 1945 besetzten sowjetische und polnische Soldaten das Werk, die Produktion endete. Der deutsche Entlastungsangriff aus dem Brückenkopf Oranienburg kam am 25. und 26. April nördlich von Germendorf an der Bahnlinie zum Stehen; wenige Tage später waren Germendorf, Friedrichsthal und Oranienburg in sowjetischer Hand.
DDR-Zeit: Demontage, Gedenkstein und neue Siedlungen
Auf Befehl der sowjetischen Militäradministration wurde das Heinkel-Werk von deutschen Arbeitskräften nahezu vollständig demontiert; am 23. Juli 1948 enteignete das Land Brandenburg das Unternehmen. Vom Werk I blieb kein Gebäude über der Erde erhalten, das frühere Lagergelände bedeckt Kiefernwald.
Zum Gedenken an die getöteten Häftlinge setzte man 1974 einen Gedenkstein an der Straße nach Velten.
1951 eröffnete die Bahnstrecke Oranienburg–Velten mit dem Haltepunkt Germendorf Süd; 1969 endete ihr Betrieb, und sie wurde abgebaut. Auf der Strecke Nauen–Oranienburg fuhren seit 1967 keine Personenzüge mehr. Neben dem Dorf entstanden nach 1945 zunächst kleine Wochenendsiedlungen, die später mit Eigenheimen verdichtet wurden.
Die Einwohnerzahl blieb über Jahrzehnte nahezu gleich: 1.088 im Jahr 1950, 1.183 im Jahr 1971 und 1.090 im Jahr 1989. Der örtliche Fußballverein trat in den 1960er Jahren als ASG Vorwärts auf und gründete sich 1972 als BSG Einheit neu.
Seit 1990: Zuzug, Tierpark und Eingliederung
Nach dem Mauerfall kamen vor allem Zuzügler aus Oranienburg und Berlin in den Ort, weil Grundstücke und Mieten günstig waren. Von 1.038 Einwohnern im Jahr 1992 stieg die Zahl auf 1.461 im Jahr 1995 und auf 1.631 im Jahr 2000.
Am westlichen Ortsausgang waren durch den Kiesabbau Seen entstanden, die nach 1990 zum Erholungsgebiet ausgebaut wurden; gegenüber dem Park liegt das Wohngebiet „An den Waldseen“ mit Einfamilien- und Reihenhäusern.
1992 begann der Aufbau des Tierparks in einer früheren Kiesgrube im Westen. Gründer war der frühere Ortsvorsteher Horst Eichholz (1932–2017), den die Stadt am 30. Juni 2000 zum Ehrenbürger des Ortsteils ernannte. 2002 erhielt der Park die Zoogenehmigung, seit 2009 gehört ein Saurierpark mit lebensgroßen Nachbildungen dazu.
Germendorf gehörte zu den sieben Gemeinden, die am 26. Oktober 2003 in der Stadt Oranienburg aufgingen. Anfang der 2000er Jahre siedelten sich neue Firmen an; 2006 waren 197 Firmen im Ort gemeldet. 2014 brannte das Feuerwehrhaus ab; den Neubau weihte man im Oktober 2016 ein.
Die Dorfkirche erhielt 2005 eine Turmsanierung, bei der 40 Steine ausgetauscht wurden, 2016 ein neu gedecktes Dach für insgesamt 195.000 Euro und 2019 eine Innenrenovierung.
Den Abschluss der Erneuerung feierte die Kirchengemeinde am zweiten Advent 2020 mit einem Festgottesdienst; Geld kam unter anderem vom Kirchenkreis, vom Land Brandenburg und aus Spenden.
Germendorf 2022: Gewerbe, Tierpark und Anger
Die Einwohnerzahl betrug am 31. Dezember 2022 laut Stadt Oranienburg 1.920. Prägende Branchen sind Handwerk, Baugewerbe, Recycling und Umwelttechnik; das größte Gewerbegebiet liegt an der Veltener Straße.
Auf dem Gelände der früheren Heinkel-Werke haben sich Baustoff- und Recyclingfirmen angesiedelt, am Ostrand liegen ein Baumarkt und der Verkehrshof der Oberhavel Verkehrsgesellschaft.
Zum Tier-, Freizeit- und Saurierpark, der nach Angaben der Stadt rund 400.000 Besucher im Jahr zählt, gehören ein Kiessee, ein Strandhotel, eine Freilichtbühne und ein Schaugarten mit Dinosauriern. Die Grundschule, 2010/2011 zur offenen Ganztagsschule geworden, entstand durch den Zusammenschluss mit der Eden-Grundschule.
Auf der alten Bahntrasse Richtung Kremmen fahren seit 2006 Draisinen. Der FSV Germendorf 1972 gewann 2010 die Kreisliga Oberhavel.